物語は、『さよなら銀河鉄道９９９』の１年後から始まる。地球は、新政府のもと表面上は平和に繁栄していた。しかし、地上の繁栄は地下に住む人々の体熱すらも奪い取るような無慈悲なエネルギー政策に支えられていたのである。地下１０ｋｍの地下世界は凍り付き、支配される人々は未来のない日を送っていた。かつて女王プロメシュームを倒して英雄として迎えられた鉄郎も、今や改革に反対する危険分子として地下牢に監禁されて処刑されようとしていた。ある日、そんな鉄郎の耳にあの懐かしい汽笛の音色が響いた。地球の平和を復活させようと、最終目的地・アルティメイト星系エターナルを目指し、鉄郎はみたび９９９に乗り宇宙へと飛び立つのだった……！　原作は松本零士の代表作であり１９７８年にＴＶアニメ化。人気作品として、３年に及ぶ期間放送され、２度にわたる映画化も大ヒットとなった！なんと１７年ぶりに映画化された本作は『月刊ビッグゴールド』で新規連載された原作を元に、劇場映画にふさわしい壮大なストーリー展開とスケール感で描かれている。９９９ファン必見の作品！