シャトルベースが宇宙獣士ドドンにハイジャックされ、チェンジマンたちはドドンの攻撃を受けて海に放り出されてしまった！一人残されたさやかは、ドドンがある電波に弱いことを発見。剣たちにその電波の出所を見つけるよう連絡し、シャトルベースの中で一人奮戦することに。一方剣はサトル少年の無線機が発信源だとつきとめた。無線機の電波を強めるとドドンは苦しんでいる。さぁ、いよいよ反撃開始だチェンジマン！シャトルベースを取り戻せ！
春に引き続き1985年夏の「東映まんがまつり」の中で公開された、劇場オリジナル第2作。