武装錬金全26話
少女を救おうとした少年、武藤カズキは化け物に胸を貫かれるが、翌朝、何事もなかったかのように目を覚ます。訝しむカズキは放課後、化け物に変化した教師の巳田に襲われる。その時、昨夜の少女からの電話が彼の携帯に…!
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(C)和月伸宏/集英社・武装錬金製作委員会
ホムンクルスを生み出した者の正体と目的を探ろうと、捜索を始めたカズキと斗貴子。二人は突如、空中から大鷲の翼を持つホムンクルスに急襲される。更に、斗貴子がホムンクルスの幼体に寄生されてしまい…。
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斗貴子のホムンクルス化を防ぐ解毒剤を入手するため、パピヨンマスクの男を探すカズキと斗貴子。同時にカズキは、武装錬金を自在に操れるようになるための特訓にも励む。そんな二人を、ホムンクルスの蛙井が襲う。
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パピヨンマスクの男を探すカズキは、死に至る病を患っているという三年生、蝶野と出会う。彼が手にしていたのは解毒剤…。蝶野こそがホムンクルスの創造主! 彼は人間型ホムンクルスとなり、死を克服しようとしていた!!
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ホムンクルスの鷲尾を前に、ホムンクルスの幼体に寄生され動きの鈍い斗貴子と、立ち向かっていくカズキ。斗貴子を守りたいというカズキと、自分を救ってくれた蝶野の望みを叶えさせたいという鷲尾、譲れない二つの想いが激突し、眩い閃光を生む!
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斗貴子を救うため、解毒剤を求めるカズキ。ホムンクルス本体の完成を待つ蝶野攻爵。対峙した二人のもとへ攻爵の弟である次郎が現れ、ホムンクルス本体の入ったフラスコを破壊してしまう。が、攻爵の執念でついに、人間型ホムンクルスのパピヨンが誕生してしまった!
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斗貴子を救ったカズキは、キャプテンブラボーよりLXE・超常選民同盟の存在と目的を知らされ、錬金の戦士としてスカウトされる。皆を守りたいという気持ちと、それには自分は力不足ではないかという気持ちに揺れるカズキ。そこへL.X.E.からの刺客、人間型ホムンクルスの金城が現る!!
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ブラボーは、カズキを錬金の戦士として鍛え上げるための特訓を開始した。一方、斗貴子は別の任務を指示される。それは、金城の使っていた核鉄を守ることだった。その夜、その核鉄を奪取せんとするホムンクルス陣内に操られた寄宿舎の生徒達が、一斉に斗貴子に襲いかかる!
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カズキは、生徒会長を務める早坂桜花と、剣道部の強豪である弟の秋水と知り合いになる。剣道の稽古を通じて近寄っていくカズキと秋水だったが…。早坂姉弟は学園に潜む錬金の戦士の捜索と抹殺を命じられたL.X.E.の信奉者だった。そんなある日、L.X.E.のホムンクルス二人が学園に乗り込んでくる。
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互いの正体を知り、驚くカズキと早坂姉弟。だが早坂姉弟に迷いはない。初手をカズキに譲った秋水は、日本刀の武装錬金“ソードサムライX”を発動させる。激しく激突する両者だったが、サムライXの煌めきは、確実にカズキの身体を切り刻んでいく。そしてついに秋水は渾身の逆胴を放つ!
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